VI GencAusdruckscSpezifikation Oktober 2003 ? Jason Stewart - Geöffnete Informatik ? Charles Troup - Agilent Der Herausgeber möchte auch seine Anerkennung zu denen ausdrücken, die an teilnahmen Programmieraufwand, zuerst gefördert durch Iobion und Affymetrix MGED, das stattfand in Toronto September 14-18, 2001 und die Sekunde gefördert von EBI, der innen stattfand Hinxton Dezember 6-11, 2001 und auch zu denen, die Ideen beitrugen. ?- Rechnung Andreopoulos - Universität von Toronto ? Eric Deutsch - leiten Sie für Systembiologie ein ? Jason Goncalves - Iobion ? Robert Hubley - leiten Sie für Systembiologie ein ? Daniel Iordan - Iobion ?- Treber Lepage - Molekularer Bergbau ? W.L. Markierungen - Iobion ? Todd Peterson - NCGR ?- Engel Pizarro - Universität von Pennsylvania ? Marcin Swiatek - BelichtungscForschung ?- Joe-Weiß - das Institut für Forschung Genomic ? John Yost - Nationales KrebscInstitut Beweis des Konzeptes EBI-Beweis des Konzeptes Europäisches Institut Bioinformatics hat auf dem Entwickeln eines allgemeinen Behälters für gearbeitet Genausdrucksdaten (ArrayExpress) seit 1999 (sehen Sie http://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/). Entwicklung ArrayExpress ist auf Gegenstandmodell ArrayExpress (AEOM) zentriert worden, und Design von Mage-om ist durch diese Erfahrung beeinflußt worden. AEOM wurde zu den Verwandtschaftstabellen abgebildet und einführte als Datenbank des Orakels 8i. Daten Ladevorrichtung von MAML (XML-Format, das ein Teil des Ausgangsgenausdruckes RFP war Antwort von EBI im Namen MGED) zu ArrayExpress wurde und einige eingeführt Modems wurden in den Behälter geladen. Eine Prototypnetzschnittstelle wird entwickelt. Wir sehen keine Hindernisse voraus, wenn wir Format Mage-ml wie ein Dateneingabeformat für annehmen ArrayExpress. Wir verwenden auch Mage-om, als Grundlage für ArrayExpress API sich entwickeln ment. NCGR-Beweis des Konzeptes Die nationale Mitte für Genombetriebsmittel hat ein Gen OpenSource entwickelt Ausdrucksdatenbankhilfsmittel, GeneX, seit 1999 (sehen Sie http://genex.ncgr.org/). das GeneX Projekt hat auf die Entwicklung eines Verwandtschaftsdatenmodells und des Entsprechens konzentriert Data-transmission Modell XML, GeneXML (sehen Sie http://www.ncgr.org/genex/gen- exml.html). NCGR nahm an der Unterordnung MGED MAML und an vielen des fea- teil tures von GeneXML wurden in MAML umfaßt.