Juni 2001 Biomolekulare ReihenfolgencAnalyse: Modul DsLSRBioObjects 2-83 2 2,1,29 Fabriken AlignmentEncoder (wahlweise freigestellt) AlignmentEncoder Fabriken liefern die Mittel des Verursachens neu CharacterAlignmentEncoder und SingleCharacterAlignmentEncoder Gegenstände. Dieses ermöglicht eine saubere Trennung der Fabrikausgaben vom AlignmentEncoder Gegenstände selbst. AlignmentEncoder Fabriken sind ein wahlweise freigestellter Befolgungpunkt dieser Spezifikation. Get_row_column_interval(in-Abstandsreihen StringList, in den Abstandscols) raises(IntervalOutOfBounds, SeqRegionInvalid); Beschreibung: Stellt Vor-blockieren vom Text für den Teil von zur Verfügung Ausrichtung vorbei definiert Reihen und cols Abstände als Reihe von den Zeichenketten . Reihen erlaubt eine Teilmenge von AlignmentElements bezogen werden. cols erlaubt eine Teilmenge von den zu beziehenden Korrespondenzen. Es gibt ein Buchstabe pro Zelle. Rückholwert: Bringt ein StringList zurück eine Zeichenkette pro Reihe. Ausnahmen: ? Erhöhungen IntervalOutOfBounds wenn Anfang der Reihen ist kleiner als 1 oder start+length-1 ist grösser als die Zahl Reihen. Dieses obere Begrenzung wird vorbei zurückgebracht num_rows() übernommen von CharacterAlignmentEncoder . ? Auch Erhöhungen IntervalOutOfBounds wenn Stern der cols' t ist kleiner als 1 oder start+length-1 ist grösser als die Spaltenanzahl. Diese obere Begrenzung wird durch num_cols() zurückgebracht übernommen von CharacterAlignmentEncoder . ? Erhöhungen SeqRegionInvalid wenn der Abstand ein unzulässiges ist SeqRegion . Beispiele schließen ein falsches mit ein StrandType oder ein unzulässiges CompositeSeqRegion (z.B., ein, das ein Unrecht hat SeqRegionOperator oder enthält Deckungen oder Kreisförmigkeiten). Get_entire_alignment() StringList; Beschreibung: Stellt den Textabschnitt für die gesamte Ausrichtung zur Verfügung als Reihe Zeichenketten . Es gibt einen Buchstaben pro Zelle. Rückholwert: Bringt ein StringList zurück eine Zeichenkette pro Reihe.