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Juni 2001 Biomolekulare ReihenfolgencAnalyse: Modul DsLSRBioObjects 2-69 2 in den Zeichenketteüberresten im Grundlagenthe_basis in den Anmerkungen AnnotationList) Erhöhungen (InvalidResidue, SeqAnnotationOutOfBounds, SeqRegionInvalid); }; 2,1,25 Iterators BioSequence (wahlweise freigestellt) Spezifikationen Iterator werden für das Wiederholen von Over ein Satz von BioSequence definiert NucleotideSequence oder AminoAcidSequence Gegenstände. NucleicAcidIterator und AminoAcidIterator sind fachkundige Versionen von BioSequenceIterator haben die gleichen Betriebe aber mit Unterzeichnungen spezialisierten sich für das entsprechende BioSequence Create_sequence(AminoAcidSequence im Zeichenkettenamen in Bezeichnerkennzeichnung in der Zeichenkettebeschreibung in den Zeichenketteüberresten im Grundlagenthe_basis in den Anmerkungen AnnotationList) Erhöhungen (InvalidResidue, SeqAnnotationOutOfBounds, SeqRegionInvalid); Beschreibung: create_sequence() Betrieb verursacht AminoAcidSequence und bevölkert es mit geliefert Attribute. Keine Fehlerprüfung wird ausgenommen an durchgeführt Überreste, die gültige Verbindung Iupac-iubmb sein müssen Kommission auf biochemischer Bezeichnung (JCBN) single Buchstabecodes. Die Überreste brauchen, nicht Versalien zu sein. BioSequenceIdentifierResolver kann zu innen gemischt werden stellen Sie das Nachschlagen zur Verfügung, das auf Reihenfolge Identifikation basiert. Bringen Sie Wert zurück: Bringt a zurück AminoAcidSequence mit dem passenden Inhalt. Ausnahmen: ? Erhöhungen InvalidResidue wenn die Zeichenkette der Überreste ist inkonsequent mit der gemeinsamen Kommission Iupac-iubmb an Biochemische einzelne Buchstabecodes der Bezeichnung (JCBN). ? Erhöhungen SeqAnnotationOutOfBounds wenn Anmerkungen enthält ein SeqAnnotation wer seq_region ist aus Grenzen für dieses BioSequence . ? Erhöhungen SeqRegionInvalid wenn die Anmerkungen Parameter enthält SeqAnnotation ein seq_region haben Attribut das wird unzulässig gemeint. Beispiele schließen ein falsches mit ein StrandType oder ein unzulässiges CompositeSeqRegion (z.B., ein das ein falsches SeqRegionOperator hat oder enthält Deckungen oder Kreisförmigkeiten). |  |
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