2-68 Biomolekulare ReihenfolgencAnalyse, v1.0 Juni 2001 2 AminoAcidSequenceFactory AminoAcidSequenceFactory stellt die Mittel des Verursachens neu zur Verfügung AminoAcidSequences . AminoAcidSequenceFactory ist eine wahlweise freigestellte Befolgung Punkt dieser Spezifikation. Schnittstelle AminoAcidSequenceFactory { Create_sequence(AminoAcidSequence im Zeichenkettenamen in Bezeichnerkennzeichnung in der Zeichenkettebeschreibung Create_sequence(NucleotideSequence im Zeichenkettenamen in Bezeichnerkennzeichnung in der Zeichenkettebeschreibung in den Zeichenketteüberresten im Grundlagenthe_basis im Booleschen Rundschreiben in den Anmerkungen AnnotationList) Erhöhungen (InvalidResidue, SeqAnnotationOutOfBounds, SeqRegionInvalid); Beschreibung: Das create_sequence() Betrieb verursacht a NucleotideSequence und bevölkert es mit geliefert Attribute. Keine Fehlerprüfung wird ausgenommen an durchgeführt Überreste, die gültige Verbindung Iupac-iubmb sein müssen Kommission auf biochemischer Bezeichnung (JCBN) single Buchstabecodes. Die Überreste brauchen, nicht Versalien zu sein. BioSequenceIdentifierResolver kann zu innen gemischt werden stellen Sie das Nachschlagen zur Verfügung, das auf Reihenfolge Identifikation basiert. Bringen Sie Wert zurück: Bringt a zurück NucleotideSequence mit dem passenden Inhalt. Ausnahmen: ? Erhöhungen InvalidResidue wenn die Zeichenkette der Überreste ist inkonsequent mit der gemeinsamen Kommission Iupac-iubmb an Biochemische einzelne Buchstabecodes der Bezeichnung (JCBN). Merken Sie, daß Überrest gedeutet wird, um Unterseite hier zu bedeuten (sehen Sie Glossar). ? Erhöhungen SeqAnnotationOutOfBounds wenn Anmerkungen enthält ein SeqAnnotation wessen seq_region ist aus Grenzen für dieses BioSequence . ? Erhöhungen SeqRegionInvalid wenn die Anmerkungen Parameter enthält SeqAnnotation ein seq_region haben Attribut das wird unzulässig gemeint. Beispiele schließen ein falsches mit ein StrandType oder ein unzulässiges CompositeSeqRegion (z.B., ein das ein falsches SeqRegionOperator hat oder enthält Deckungen oder Kreisförmigkeiten).