2-50 Biomolekulare ReihenfolgencAnalyse, v1.0 Juni 2001 2 Get_gaps(CompositeSeqRegion im Zeichenketteschlüssel im Abstand the_interval) raises(ElementNotInAlignment, IntervalOutOfBounds, SeqRegionInvalid); Beschreibung: Der Eingangsparameter- Schlüssel kennzeichnet eindeutig AlignmentElement innerhalb Ausrichtung . Für jedes Korrespondenz, jedes AlignmentElement hat Abstände zurückgebracht durch get_gaps() . Ein ungültiges CompositeSeqRegion zeigt das dort an sind keine Abstände. Der Eingangsparameter the_interval stellt einen Abstand in dar Koordinaten der Ausrichtung nicht der des zugrundeliegenden Gegenstandes . Es wird angenommen, daß die Numerierung der Korrespondenzen relevant ist (d.h., das die zweite Korrespondenz kommt nach der ersten, mit allen die berührenden Abstände). Dieses erlaubt Abstand von den Korrespondenzen ein gültiges Konzept sein. Rückholwert: Bringt ein CompositeSeqRegion zurück . Der Anfang und Länge von jedem konstituierendes SeqRegion zeigt die Position, in der Koordinate an System des zugrundeliegenden Gegenstandes und Zahl von Abständen an der Position. Abstände von Länge 0 werden nicht erlaubt. Ein Anfang, der bis 0 wurde gleich ist seien Sie vor der ersten Unterseite. Ein Anfang, der N gleich ist, ist ein Abstand zwischen Unterseiten N und Anfang N+1. So gleich dem Gegenstand ' s-Länge würde nach sein letzte Unterseite. Ausnahmen: ? Erhöhungen ElementNotInAlignment wenn das AlignmentElement ist dazugehörig nicht mit dieser Ausrichtung. ? Erhöhungen IntervalOutOfBounds wenn Anfang des Abstands ist kleiner als 1 oder wenn sein start+length-1 ist grösser als die Gesamtzahl von Korrespondenzen gegeben durch num_columns () . ? Erhöhungen SeqRegionInvalid wenn the_interval ist ein unzulässiges SeqRegion . Beispiele schließen ein falsches mit ein StrandType oder unzulässiges CompositeSeqRegion (z.B., ein, das ein Unrecht hat SeqRegionOperator oder enthält Deckungen oder Kreisförmigkeiten).