Juni 2001 Biomolekulare ReihenfolgencAnalyse: Modul DsLSRBioObjects 2-33 2 Zeichenkettetranslate_seq_region( im seq_region SeqRegion aus stop_locations UnsignedLongList) raises(SeqRegionOutOfBounds, SeqRegionInvalid); Beschreibung: translate_seq_region() führt eine Übersetzung einer definierten Region durch von einem NucleotideSequence spezifiziert durch SeqRegion Argument. Kein Leserahmen ist- weil notwendig SeqRegion definiert Rahmen. Ein SeqRegion wird hier anstelle von einem Abstand angefordert weil nicht-angrenzende Segmente von a NucleotideSequence können Sie müssen Sie, wie im Fall von einem DNA-Reihenfolgenenthalten spezifiziert werden introns. Wenn eine Region, die für Übersetzung eingereicht wird, Vor-Regionen enthält, alle Vor-Regionen werden im Tiefe-ersten Auftrag vor Übersetzung verkettet. Wenn Folgendregion ' s StrandType ist STRAND_MINUS die Zeichenkette zurückgegangen sollte genommen werden, wie bevor Sein Rück-ergägenzt worden übersetzt. Rückholwert: Die zurückgebrachte Zeichenkette besteht aus single-letter Versalieniupac- Gemeinsame Kommission IUBMB auf biochemischer Bezeichnung (JCBN) Zeichenkodes für die übersetzten Aminosäuren. Irgendein interner Anschlag codons werden durch ' * '. das UnsignedLongList heraus dargestellt Parameter stop_locations enthält die Positionen von irgendwie internem Anschläge (Abschlußwiderstände) in der Proteinübersetzung. Ausnahmen: ? Erhöhungen SeqRegionOutOfBounds wenn irgendwelche enthielten Abstands Anfang ist kleiner als 1 oder sein start+length-1 ist grösser als Länge des NucleotideSequence . Wenn NucleotideSequence stellt kreisförmige DNA, dann diese dar Ausnahme sollte angehoben werden wenn das SeqRegion ' s- Anfang ist kleiner als 1 oder grössere als die Länge vom NucleotideSequence oder wenn seine Länge ist grösser als das des NucleotideSequence . ? Erhöhungen SeqRegionInvalid wenn seq_region ist unzulässig. Beispiele schließen Sie ein falsches StrandType mit ein oder ein unzulässiges CompositeSeqRegion (z.B., ein, das ein Unrecht hat SeqRegionOperator oder enthält Deckungen oder Kreisförmigkeiten).