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2-30 Biomolekulare ReihenfolgencAnalyse, v1.0 Juni 2001 2 ReadingFrameInvalid NucleotideSequence NucleotideSequence verlängert BioSequence und stellt eine DNA oder eine RNS dar ordnen Sie der Reihe nach und stellt eine Anzahl von Betrieben für die Manipulierung der Reihenfolgendaten zur Verfügung. Es gibt einen tatsächlichen Directionality von Nukleotidreihenfolgendaten, von 5' zu 3'. Schnittstelle NucleotideSequence: BioSequence { Boolesches Rundschreiben des schreibgeschützten Attributes; Zeichenkettereverse_complement(); Zeichenkettereverse_complement_interval(inabstand the_interval) raises(IntervalOutOfBounds, SeqRegionInvalid); Zeichenkettetranslate_seq( im kurzen reading_frame aus stop_locations UnsignedLongList) raises(ReadingFrameInvalid); Zeichenkettetranslate_seq_region( im seq_region SeqRegion aus stop_locations UnsignedLongList) raises(SeqRegionOutOfBounds, SeqRegionInvalid); }; Ausnahme ReadingFrameInvalid { kurzes unzulässiges; }; Beschreibung: Das ReadingFrameInvalid Ausnahme wird wenn der Messwert angehoben Rahmen ist nicht zwischen -3 und +3, ausschließlich null . Rückholwert: Bringt einen Kurzschluß zurück Enthalten des unzulässigen Leserahmens. Boolesches Rundschreiben des schreibgeschützten Attributes; Beschreibung: Das Rundschreiben Attribut liefert eine Einheit, um anzuzeigen ob ein NucleotideSequence ist kreisförmig, wie der Fall für Plasmide oder bestimmte Mikrobenchromosomen. Rückholwert: Bringt ein ZUTREFFENDES wenn das NucleotideSequence zurück ist kreisförmig und FALSCH anders. |  |
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