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Juni 2001 Biomolekulare ReihenfolgencAnalyse: Modul DsLSRBioObjects 2-29 2 BioSequenceList 2,1,11 Formationsglieder von BioSequence Die Datenart BioSequence ist eine Schnittstelle, die biologische Reihenfolgen darstellt. Alle Fälle der tatsächlichen biologischen Reihenfolgen werden erwartet, um von einer von abzuleiten BioSequence Formationsglieder, NucleotideSequence oder AminoAcidSequence (oder fachkundige Formationsglieder davon). Reihenfolgeninformationseingabe zu einem BioSequence oder für fragende Zwecke ist Schachtel verwendet unempfindlich. Reihenfolgeninformationsausgabe von einem BioSequence wird mit Upper- zurückgegangen umkleiden Sie ASCII-Zeichenketten der gemeinsamen Kommission Iupac-iubmb auf biochemischer Bezeichnung (JCBN) single-letter Zeichenkodes. AminoAcidSequence stellt eine Proteinreihenfolge dar und enthält nicht irgendwelche Betriebe. Ein Rückübersetzungsverfahren, dem eine Nukleinsäurereihenfolge von produziert die Aminosäurereihenfolge ist ein komplizierter Betrieb, der nicht direkt ist zu standardisieren diesmal. Tabelle 2-10 Die Schnittstellen NucleotideSequence und AminoAcidSequence UnsignedLongList typedefsequence<BioSequence > -BioSequenceList; Beschreibung: Verwendete, einen Satz von BioSequences zu führen . typedef sequence<unsigned lang > UnsignedLongList; Beschreibung: Verwendete, einen Satz von zu führen nicht unterzeichnete longs. NucleotideSequence Rundschreiben: Boolesch reverse_complement() reverse_complement_interval() translate_seq() translate_seq_region() < < Schnittstelle > > AminoAcidSequence < < Schnittstelle > > LifeCycleObject < < Schnittstelle > > BioSequence < < Schnittstelle > > |  |
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