2-24 Biomolekulare ReihenfolgencAnalyse, v1.0 Juni 2001 2 SeqRegionInvalid NotUpdateable BioSequence Ein BioSequence ist eine Abstraktion einer biologischen Reihenfolge, wie bestellt Nukleotide einer DNA-Kette oder der bestellten Aminosäureüberreste eines Proteinmoleküls. Das BioSequence Schnittstelle liefert wesentliche Eigenschaften der biologischen Reihenfolgen (Name Kennzeichnung Beschreibung Länge und Betriebe für das Erreichen der Ordnungsfolge selbst oder eine Vor-Reihenfolge als ASCII-Zeichenkette der gemeinsamen Kommission Iupac-iubmb an Biochemische einzelne Buchstabeversaliencodes der Bezeichnung (JCBN) (seq() seq_interval() ). BioSequence übernimmt von CosLifeCycle::LifeCycleObject . Schnittstelle BioSequence: CosLifeCycle::LifeCycleObject { schreibgeschützte Attributzeichenkette Name; schreibgeschützter Attributbezeichner Kennzeichnung; schreibgeschützte Attributzeichenkette Beschreibung; schreibgeschützte Attributzeichenkette folgend; nicht unterzeichnetes langes des schreibgeschützten Attributes Länge; schreibgeschützte Attributgrundlage the_basis; Zeichenkette seq_interval(inabstand the_interval) Ausnahme SeqRegionInvalid { Zeichenkettegrund; }; Beschreibung: Das SeqRegionInvalid Ausnahme wird wenn ein SeqRegion angehoben oder CompositeSeqRegion ist in einem gegebenen Kontext unzulässig. Beispiele schließen das StrandType mit ein STRAND_BOTH sein beim Versuchen, eine Nukleotidreihenfolge oder ein Unrecht zu übersetzen SeqRegionOperator , Deckungen oder Kreisförmigkeit in a CompositeSeqRegion überschritten als in Parameter. Rückholwert: Bringt eine Zeichenkette zurück, die den Grund das SeqRegion enthält ist unzulässig. Ausnahme NotUpdateable { Zeichenkettegrund; }; Beschreibung: Das NotUpdateable Ausnahme wird wenn angehoben BioSequence ist unabänderlich. Rückholwert: Bringt eine Zeichenkette zurück, die den Grund das BioSequence enthält kann nicht aktualisiert sein.