Juni 2001 Biomolekulare ReihenfolgencAnalyse: Modul DsLSRBioObjects 2-15 2 SeqAnnotation kann a verbinden BioSequence mit analytischen Resultaten oder beschreibend Informationen wie biologische Funktion. Ein Reihenfolgenanalysendurchlauf konnte erzeugen SeqAnnotation Gegenstände als Ausgang. Zusätzlich BioSequence Fabriken können zu benutzt werden bringen Sie SeqAnnotations an zum BioSequences . Zu steuern ist nicht z.Z. möglich, von einem SeqAnnotation zu einem BioSequence die Schnittstellen definiert in dieser Spezifikation verwenden. Ein kann einen Satz von jedoch erhalten SeqAnnotations gegebenes a BioSequence . Dieses ist vom Gesichtspunkt von a genügend ordnen Sie Analysenanwendung der Reihe nach, die angemerkte Reihenfolgen produzieren könnte. Die Submitters von diesem Spezifikationsgefühl, daß es reichere Modelle für Anmerkungen auf Reihenfolgen gibt (z.B., komplizierte Hierarchien oder Diagramme von Verhältnissen zwischen Anmerkungen und Reihenfolgen wie Brunnen als die Anmerkungen selbst). Reihenfolgenanmerkungen werden erwartet adressiert zu werden in einer Zukunft RFP. Die Gebräuche und die Deckung von Anmerkungen veranschaulichen und SeqAnnotations mit Respekt zu den Resultaten der Reihenfolgenanalysen, werden einige mehr Beispiele nachstehend aufgeführt: Motivanalyse des ? A bringt ein beschriftetes Muster (z.B., KRINGLE) eine gegebene Region zusammenbringend zurück von der Proteinreihenfolge. Beschränkungs-Diagrammanalyse des ? A bringt eine Liste der Aufstellungsorte, für die gegebenen Enzyme zurück, die können dann seien verwendet Sie, die DNA-Reihenfolge zu kommentieren. ? das Resultat der Homologieanalyse schlägt vor, daß die Reihenfolge einer Einzelheit gehört Genfamilie, die auf das NucleotideSequence kommentiert werden kann Umfassen Informationen betreffend sind Grad der Sicherheit. ? ORF und Gen-Findenanalysen kennzeichnen Kodierungregionen, die später wie addiert werden orientierte Geneigenschaften auf der Reihenfolge. die übereinstimmenden Regionen des ?, die gefunden werden, indem man eine Ausrichtungsanalyse verwendet, können wie kommentiert werden SeqAnnotations auf der Fragenreihenfolge. ? ein Phosphorylierungaufstellungsort EMBL-curated auf einem Protein gespeichert (importiert) als a SeqAnnotation auf AminoAcidSequence . ? gekennzeichnete Veränderungen von den mehrfachen DNA-Reihenfolgen können in vermischt werden SeqAnnotations auf einer Übereinstimmungsreihenfolge. Verlängerndes SeqAnnotation stellt eine Einheit für das Verursachen der stark geschriebenen Reihenfolge zur Verfügung Eigenschaften. Dieses kann für bestimmte stereotypical Reihenfolgeneigenschaften wie angebracht sein Gene, exons und regelnde Aufstellungsorte des transcriptional, die Komplex aber recht wohl haben definierte Semantik. Diese spezialisierten SeqAnnotations konnte die notwendigen Daten definieren Arten und Vor-Eigenschaftseindämmung-Verhältnisse, wie passend für die spezifische Eigenschaft. Die Ausgabe des Kommentierens von BioSequences sowie andere Bio-Gegenstände sind kompliziert und wir schlagen nicht eine endgültige Lösung in der anwesenden Spezifikation vor. Das IDL ist bearbeitbar für biomolekulare Reihenfolge ist Analyse und dort genügender Raum für Ausarbeitung durch a zukünftige LSR-Anmerkung RFP.