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2-8 Biomolekulare ReihenfolgencAnalyse, v1.0 Juni 2001 2 SeqRegionList CompositeSeqRegion CompositeSeqRegion , eine Spezialisierung von SeqRegion , kann null oder mehr enthalten Vor-Regionen. Ein CompositeSeqRegion ' s-Vor-Regionen können sich decken. Genistet oder hierarchisches Verhalten ist nützlich, wenn man komplizierte Eigenschaften auf BioSequences beschreibt . Dort ist keine Begrenzung zur Verschachtelung. Alles CompositeSeqRegions werden erwartet, in a übersetzt zu werden Tiefe-erstes traversal, entlang jedem Nullpunkt des Baums dargestellt worden durch CompositeSeqRegions . Dieses umfaßt jene Nullpunkte, die haben region_operator Gleichgestelltes zum VERBINDEN oder AUFTRAG . allgemeines strand_type StrandType; Beschreibung: Für NucleotideSequences strand_type stellt zur Verfügung Anzeige über ob das SeqRegion bezieht sich die auf Vorlage Plusfaser, die ergänzende Minusfaser oder beide Fasern eines double-stranded Moleküls. STRAND_MINUS wenn verwendet Sie seien, eine Region auf der Rückseite anzuzeigen Ergänzung von einem NucleotideSequence . Für diese Regionen, Anfang und Länge (übernommen vom Abstand beziehen Sie sich Positionen innerhalb des beigeordneten Systems vom ursprünglichen, gegeben Faser. strand_type wenn seien Sie STRAND_NOT_APPLICABLE für Regionen von AminoAcidSequences . Rückholwert: Bringt ein StrandType zurück . allgemeines Boolesches start_relative_to_seq_end; Beschreibung: Das start_relative_to_seq_end Mitglied kann ändern Semantik des Anfangsmitgliedes: wenn start_relative_to_seq_end ist ZUTREFFEND, Anfang ist genommen zu werden vom Ende der Reihenfolge, anstatt vom Anfang. Nein Rück-Ergänzung wird angedeutet. Das heißt, wenn Reihenfolge a hat Länge 100 und SeqRegion hat Anfang = 20 Länge = 10 und start_relative_to_seq_end = ZUTREFFEND, läuft die Region von Position 81 bis zu und Mit.einschließen 90. Rückholwert: Bringt ein Boolesches zurück . typedefsequence<SeqRegion > -SeqRegionList; Beschreibung: Verwendete, einen Satz von SeqRegions zu führen . |  |
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