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Juni 2001 Biomolekulare ReihenfolgencAnalyse: Modul DsLSRBioObjects 2-5 2 enumgrundlage { BASIS_NOT_KNOWN, BASIS_NOT_APPLICABLE, BASIS_EXPERIMENTAL, BASIS_COMPUTATIONAL, BASIS_BOTH }; 2,1,4 Abstand Eine angrenzende Teilkette innerhalb einer größeren Zeichenkette wird mit dem Abstand spezifiziert valuetype. Ein Abstand besteht aus einen Anfang und Länge und definiert die Ausgangsposition der Teilkette und die Größe der Teilkette (Zahl der Maßeinheiten). BioSequences werden Beginnen numeriert bei Anfang 1, in Uebereinstimmung mit der vorhandenen Praxis auf dem Gebiet der molekularen Biologie. Abstand auf a BioSequence von start=5 würde length=10 in der 5. Position beginnen und umfassen Sie bis zur 14. Position einer Reihenfolge. Der Gebrauch von einem Anfang und Länge anstelle von Anfang und Ende stellt eine leistungsfähige Einheit zur Verfügung für das Definieren von Abständen entlang biologischen Reihenfolgen, das gut für lineares funktioniert und kreisförmige Moleküle. Tabelle 2-3 Das Abstandsvaluetype valuetypeabstand { allgemeiner nicht unterzeichneter langer Anfang; allgemeine nicht unterzeichnete lange Länge; }; BASIS_NOT_KNOWN BASIS_NOT_KNOWN wenn in allen Fällen verwendet Sie seien nicht unten angezeigt. BASIS_NOT_APPLICABLE BASIS_NOT_APPLICABLE wenn an gewöhntSEIEN Sie zeigen Sie diese Grundlage an trifft nicht zu. BASIS_EXPERIMENTAL BASIS_EXPERIMENTAL wenn an gewöhntSEIEN Sie zeigen Sie ein experimentelles Resultat an. BASIS_COMPUTATIONAL BASIS_COMPUTATIONAL wird verwendet, a anzuzeigen Berechnungsanalyse, wie von die Anwendung von ein Reihenfolgenanalysenprogramm. BASIS_BOTH Jedes mögliches Resultat stellte beide experimentell fest und sollte BASIS_BOTH rechnerisch verwenden . Abstand Anfang: nicht unterzeichnetes langes Länge: nicht unterzeichnetes langes < < valuetype > > |  |
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