1-2 Biomolekulare ReihenfolgencAnalyse, v1.0 Juni 2001 1 Die Anmerkung Fabrik, das BioSequence iterators und Fabriken, SeqAnnotation iterator, GeneticCode Fabrik und AlignmentEncoders und Fabriken sind wahlweise freigestellt Schnittstellen. Die Anmerkung Fabrik, das BioSequence iterators und Fabriken, GeneticCode fac- tory und AlignmentEncoders und Fabriken sind wahlweise freigestellte Schnittstellen. 1,2 Modul DsLSRAnalysis Das DsLSRAnalysis Modul definiert die Bestandteile für stützende Reihenfolgenanalyse durch ein generisches Analysendesign. Das Modul liefert die Mittel, Analysen abzufragen Eingänge, Ausgang und Funktionalität. Eine Analyse kann sowie asynchronously durchgeführt werden synchron gegründet worden auf der Klientenanforderung. Die Durchführung von Analysen kann vorbei überwacht werden Unterzeichnen zu einer Fallführung oder -Polling für Zustand. 1,3 GebietscModell Das Gebietsmodell wird in XML ausgedrückt. Das Gebietsmodell umfaßt ein einfaches classifica- tion von Analysen. Dieses ist in Erwiderung auf die vorgeschriebene Anforderung des RFP und dient die Analysen in Gruppen in einer dieser Weise nah organisieren Gleiche mit wie Forscher und bioinformaticists denken ungefähr und verwenden solche Analysen. Diese Klassifikation von Analysen besteht aus drei ausgedehnten Kategorien. ?- Suchen - einschließlich des Ähnlichkeitsuchens (z.B., KNALL) ?- Ausrichtung - einschließlich des contig ?- Dienstprogramme - einschließlich des Molekulargewichtes und DES GASCHROMATOGRAPHIE-Inhalts 1,4 Allgemeine Anmerkungen Dieses Dokument adressiert die Darstellung einer Anzahl von biologischen Gegenständen, sowie Einheiten für das Analysieren sie. Einige entwerfen Grundregeln und Muster, die benutzt wurden, sind zuerst umrissen. Gegenstand-durch-Wert 1,4,1 Dieses Dokument bildet umfangreichen Gebrauch vom Gegenstand-durch-Wert (OMG-Dokument orbos/98-01-18, das in den CORBA-Kern enthalten wurde, Dokument der Version 2,3). A valuetype ist ein Wesen, das zwischen einem IDL halb ist Schnittstelle und ein IDL struct . Sie werden nicht noch weit durch alles ORBs gestützt, aber wir denken, daß sie ein sehr nützliches con- sind struct, wie sie versprechen zur Verfügung zu stellen: ?- Wahl: der Klient kann beschließen, den Gegenstand ' lokal ' zu bilden oder ihm Direktübertragung zu lassen, besseres scalability des ?: nur eine einzelne runde Reise bringt den vollständigen Zustand des Gegenstandes, ?- extendibility durch Erbschaft, ungültige Wertsemantik des ?.