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Juni 2001 Biomolekulare ReihenfolgencAnalyse, v1.0 1-1 Überblick 1 Inhalt Dieses Kapitel enthält die folgenden Abschnitte. Das Gebiet der biomolekularen Reihenfolgenanalyse enthält die Vor-Gebiete von biologischem Gegenstände und Analyseneinheiten. Die Module, die diese Bereiche adressieren, werden innen beschrieben die folgenden Abschnitte. 1,1 Modul DsLSRBioObjects Biologische Gegenstände, die zu dieser Spezifikation zentral sind, schließen BioSequence mit ein das ist spezialisiert in NucleotideSequence und AminoAcidSequence . Eine Anmerkung Gegenstand wird zur Verfügung gestellt, der in SeqAnnotation spezialisiert wird für Verbrauch mit BioSe- quences . SeqAnnotations kann auf spezifische Teile einer Reihenfolge und das mecha- zutreffen das nism zum Beziehen auf dieser Regionen wird von SeqRegion zur Verfügung gestellt und Abstand . CompositeSeqRegion stellt die Fähigkeit zur Verfügung zu nisten SeqRegions . GeneticCode , mit einem Organismus,IST ein zusätzlicher Gegenstand verbunden, der wenn er Reihenfolgen benötigt wird, übersetzt. Die Schnittstellen- Ausrichtung und untergeordnete Arten werden für das Darstellen von Vergleichen benutzt zwischen Reihenfolgen oder Reihenfolgenfamilien. Sie wird auch verwendet, wenn man SimilaritySearch- beschreibt Erfolge (d.h., Gleiche fanden in der Reihenfolgendatenbank und Versammlungen ) . SearchHit und SearchResult werden hauptsächlich für das Darstellen der Resultate der Ähnlichkeit sucht verwendet (z.B., KNALL). AbschnittcTitel Seite "Modul DsLSRBioObjects" 1 -1 "Modul DsLSRAnalysis" 1 -2 "GebietscModell" 1 -2 "Allgemeine Anmerkungen" 1 -2 |  |
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